Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim3Q9R1R2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim3Q9R1R2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim3Q9R1R2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim3Q9R1R2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim3Q9R1R2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim3Q9R1R2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim3Q9R1R2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim3Q9R1R2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim3Q9R1R2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim3Q9R1R2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim3Q9R1R2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim3Q9R1R2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim3Q9R1R2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim3Q9R1R2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim3Q9R1R2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim3Q9R1R2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim3Q9R1R2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim3Q9R1R2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim3Q9R1R2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim3Q9R1R2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim3Q9R1R2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim3Q9R1R2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim3Q9R1R2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim3Q9R1R2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim3Q9R1R2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim3Q9R1R2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim3Q9R1R2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim3Q9R1R2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim3Q9R1R2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim3Q9R1R2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim3Q9R1R2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim3Q9R1R2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms