Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rfwd2Q9R1A8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms