Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms