Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms