Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms