Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms