Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms