Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms