Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms