Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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