Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ0

Litaf, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor homolog, mousemouse

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LitafQ9JLJ0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LitafQ9JLJ0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
LitafQ9JLJ0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LitafQ9JLJ0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms