Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nectin3Q9JLB9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms