Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Cnot9Q9JKY0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Cnot9Q9JKY0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot9Q9JKY0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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