Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms