Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms