Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Tuba8Q9JJZ2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Tuba8Q9JJZ2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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Tuba8Q9JJZ2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Tuba8Q9JJZ2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Tuba8Q9JJZ2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Tuba8Q9JJZ2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Tuba8Q9JJZ2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Tuba8Q9JJZ2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Tuba8Q9JJZ2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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