Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms