Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms