Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms