Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pgpep1Q9ESW8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms