Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms