Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms