Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER80

Rtp4, Receptor-transporting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp4Q9ER80 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtp4Q9ER80 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms