Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms