Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQS3

Mycbp, c-Myc-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MycbpQ9EQS3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MycbpQ9EQS3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms