Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn3Q9DCB1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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