Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms