Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms