Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms