Protein–RNA interactions for Protein: Q9D979

Uncharacterized protein C17orf64 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D979 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D979 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D979 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D979 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D979 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D979 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D979 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D979 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D979 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D979 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D979 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D979 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D979 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D979 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D979 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D979 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D979 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D979 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D979 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D979 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D979 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D979 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D979 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D979 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D979 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D979 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D979 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D979 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D979 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D979 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D979 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D979 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D979 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D979 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D979 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D979 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D979 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D979 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D979 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D979 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D979 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D979 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D979 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D979 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D979 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D979 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D979 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D979 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D979 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D979 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D979 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D979 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D979 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D979 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D979 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D979 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D979 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D979 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D979 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D979 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D979 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D979 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D979 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D979 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D979 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D979 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D979 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D979 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D979 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D979 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D979 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D979 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D979 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D979 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D979 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D979 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D979 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D979 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D979 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D979 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D979 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D979 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D979 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D979 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D979 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D979 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D979 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D979 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D979 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D979 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D979 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D979 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D979 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D979 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D979 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D979 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D979 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D979 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D979 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D979 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms