Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chmp5Q9D7S9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms