Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms