Protein–RNA interactions for Protein: Q9D720

Nsmce1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce1Q9D720 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nsmce1Q9D720 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms