Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6X5

Slc52a3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a3Q9D6X5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc52a3Q9D6X5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms