Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sec23bQ9D662 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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