Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms