Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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