Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D454 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D454 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D454 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D454 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D454 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D454 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D454 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D454 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D454 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D454 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D454 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D454 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D454 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D454 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D454 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D454 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D454 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D454 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D454 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D454 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D454 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D454 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D454 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D454 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D454 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D454 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D454 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D454 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D454 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D454 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D454 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D454 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D454 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D454 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D454 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D454 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D454 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D454 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D454 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D454 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D454 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D454 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D454 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D454 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D454 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D454 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D454 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D454 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D454 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D454 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D454 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D454 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D454 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D454 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D454 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D454 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D454 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D454 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D454 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D454 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D454 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D454 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D454 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D454 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D454 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D454 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D454 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D454 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D454 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D454 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D454 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D454 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D454 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D454 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D454 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D454 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D454 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D454 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D454 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D454 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D454 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D454 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D454 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D454 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D454 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D454 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D454 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D454 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D454 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D454 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D454 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D454 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D454 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D454 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D454 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D454 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D454 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D454 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D454 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms