Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3P1

Tchhl1, Trichohyalin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tchhl1Q9D3P1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tchhl1Q9D3P1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tchhl1Q9D3P1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tchhl1Q9D3P1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tchhl1Q9D3P1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tchhl1Q9D3P1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tchhl1Q9D3P1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tchhl1Q9D3P1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tchhl1Q9D3P1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tchhl1Q9D3P1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tchhl1Q9D3P1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tchhl1Q9D3P1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tchhl1Q9D3P1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tchhl1Q9D3P1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tchhl1Q9D3P1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tchhl1Q9D3P1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tchhl1Q9D3P1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tchhl1Q9D3P1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tchhl1Q9D3P1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tchhl1Q9D3P1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tchhl1Q9D3P1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tchhl1Q9D3P1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tchhl1Q9D3P1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tchhl1Q9D3P1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tchhl1Q9D3P1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tchhl1Q9D3P1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tchhl1Q9D3P1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tchhl1Q9D3P1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tchhl1Q9D3P1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tchhl1Q9D3P1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tchhl1Q9D3P1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tchhl1Q9D3P1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tchhl1Q9D3P1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tchhl1Q9D3P1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tchhl1Q9D3P1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tchhl1Q9D3P1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tchhl1Q9D3P1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tchhl1Q9D3P1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms