Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Elp3Q9CZX0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Elp3Q9CZX0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms