Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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