Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prelid3bQ9CYY7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prelid3bQ9CYY7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms