Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssu72Q9CY97 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms