Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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