Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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Fcf1Q9CTH6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Fcf1Q9CTH6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Fcf1Q9CTH6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Fcf1Q9CTH6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Fcf1Q9CTH6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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Fcf1Q9CTH6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Fcf1Q9CTH6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Fcf1Q9CTH6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms