Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms