Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ifitm3Q9CQW9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ifitm3Q9CQW9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ifitm3Q9CQW9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ifitm3Q9CQW9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ifitm3Q9CQW9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ifitm3Q9CQW9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ifitm3Q9CQW9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ifitm3Q9CQW9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ifitm3Q9CQW9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms