Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ykt6Q9CQW1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms