Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ8

Cmc1, COX assembly mitochondrial protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmc1Q9CPZ8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmc1Q9CPZ8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms