Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg3Q9CPX6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms